舟山自宋代起便有各种灾害的记载。
自宋至民国时期的上世纪三十年代，发生地震四次、海啸一次、龙卷风三次。
四次地震发生的时间是：明万历三十二年（1604）十一月初九夜；清道光二十六年（1846）六月十三日戌时；清咸丰三年（1853）三月七日戌时；民国六年（1917）一月三日午刻。这四次地震除了民国时期那一次外，都发生在夜里。所谓“戌时”，就是夜里7至9时之间。对这四次地震造成的伤害，志书上都未作说明，那时候也不可能有震级记录。就一般常识推测，地震对舟山的危害不大，不然的话，志书上不会一字不提。
一次海啸发生在元至正四年（1344）。这次海啸，《宁波市志》、《镇海县志》都有记载，但都只记“海啸”二字。《宁波市志》还加一句“宁海县海水上涌二三十里地”。
三次龙卷风对舟山人的生命财产危害甚大，记载也较详一些。最早一次在宋淳熙四年（1177），“白龙见东际，颠风挟潮，淹没民居”。明万历十五年（1587）七月二十日，这次龙卷风危害极大。光绪《定海厅志》记载：“龙风卷潮，禾黍一空，居民采草木食，既而鬻男女以食。”龙卷风裹着潮水涌入岛内，将庄稼洗劫一空，人们只能以草根树皮充饥，甚至买儿鬻女人吃人。后来一次发生在清乾隆五十五年（1790）五月间，“舟山龙起，漫没田庐，淹毙人口”。光绪《定海厅志》在记述这一条灾害后，又说，这条“龙”三天后从空中坠至地面，此时已被斩成三段，身子都在，只是不见了尾巴。村民将“龙”的残骸拿去“熬肉作油”，将其鳞揭下大似蒲扇，色灰白。这好像在说神话，看样子是后人“狗尾续貂”续上去的。
舟山的自然灾害发生得最频繁的是台风，过去没有“台风”一说，只知道是大风雨，民间称“打暴”、“做风水”。这样的大风雨每年秋天都要来几次，有些年颠风挟潮，来得特别猛烈，志书上称作“海沸”、“海溢”，海水像沸腾了一般冲上岛来，碎船溺人，淹没庄稼。如明万历三年（1575）五月三十日，“大风雨坏各关兵船数十艘，溺死兵民万余，禾稼尽淹”。清同治三年（1864）六月十日，“暴风雨坏舟，溺死兵民无数”。清道光二十三年（1843），其时正值英国侵略军占领舟山期间，那一年七八月间，大风雨竟一连来了三次：“闰七月初八夜，风雨大作，势若雷鸣；二十五日又大水，平地深数尺；八月初八日复大水，势更滔天，出蛟无数，洞岙、芦蒲等庄漂没百余人。”“出蛟无数”，指一条条被大风雨冲刷出来的水流，雨水和着潮水冲垮了房屋，漂没了人和牲口。民国十一年（1922）八月的一次大台风，情况要比1843年的一次更厉害。民国《定海县志》载：“飓风自东北来，骤雨海溢数日，少间又作，凡七次，最后益甚，田庐人畜被灾，为百年来所未有。”
志书上记载的舟山历史上灾害，有两处写到大灾后的疫病流行。一次是明万历十五年，因为“龙风卷潮，禾黍一空”，以致出现人食人的现象，接着流行开来的便是瘟疫，人大批大批地死去，“?殍载道”，路上堆满了死人。还有一次发生在清道光十三年（1833），因发大水，庄稼被毁，人们争食草根树皮，以致“疠疫继之，道?相望”。
舟山的自然灾害中还有旱灾、蝗灾，不过旱灾的次数及危害程度远比台风要小，蝗灾只是偶尔为之，较少发生。